Sienten ja sienimyrkkyjen seoksia - taudinaiheuttajayhteisön vaikutus ruokaturvaan

Varastotaudit aiheuttavat merkittäviä tappioita porkkanan tuotannossa. Aiemmin olemme määrittäneet varastotappiot ja tärkeimmät sienitautien aiheuttajat (Latvala et al. 2024). Olemme myös analysoineet peltojen maaperän mikrobiomeja (Velmala et al. julkaisematon) ja sairaita porkkanoita (Karisto et al. julkaisematon) amplikonisekvensoinnilla. Tässä tutkimuksessa pyrimme jatkamaan menetelmien ja Luken asiantuntemuksen kehittämistä tutkiaksemme tärkeimpien porkkanatauteja aiheuttavien sienten patogeenisuutta erikseen ja sekainfektioina sekä niiden mykotoksiinituotantoa. Tämä tukee Luken tavoitteita turvallisemman tuotannon ja ympäristön, bioturvallisuusriskien tunnistamisen sekä elintarviketurvan ja terveyden parantamisen osalta.

Patogeenisten sienten, kuten Fusariumin, Mycocentrosporan ja Alternarian, infektiot aiheuttavat tappioita, mutta myös mahdollisen mykotoksiinikontaminaation riskin. Näiden sienten mykotoksiinituotantoa porkkanassa ei ole tutkittu Pohjoismaissa. Meneillään olevasta tutkimuksestamme (Carrotoxin, MYR-säätiö, 2025-2026) tiedämme, että tärkeimmät porkkanaa pilaavat Fusarium-lajit (F. avenaceum, F. torulosum) voivat tuottaa huomattavia määriä mykotoksiineja riisiviljelmissä. Tässä projektissa pyrimme tutkimaan useiden muiden porkkanan sienitauteja tuottavia mykotoksiineja in vitro ja in planta, sekä selvittämään niiden vaikutusta elintarviketurvallisuuteen.

Hankkeen metodologinen kehitys ja kokeet hyödyttävät porkkanan varastointitautitutkimusta.

Hankkeessa on kaksi työpakettia. WP1: Porkkanoiden sieni-inokulaation kehittäminen ja porkkanan tärkeimpien sienitauteja aiheuttavien mikrobien patogeenisuuskokeet kehitettyä menetelmää käyttäen; WP2: Porkkanan mykotoksiinianalyysimenetelmän kehittäminen; varastotautisienien riisiviljelmässä ja porkkanassa tuottamien mykotoksiinien tutkiminen kehitettyä menetelmää käyttäen ja niiden vaikutus elintarviketurvallisuuteen.

WP1: Testataan erilaisia ​​sieni-inokulaatiomenetelmiä tehokkaan menetelmän kehittämiseksi porkkanoiden laajamittaisiin patogeenisuuskokeisiin. Näihin menetelmiin kuuluvat porkkanan inokulointi sieni-itiöillä ja/tai sienirihmastolla normalisoinnin mahdollistamiseksi sekä agar-tulppainokulointi. Kehitetyllä menetelmällä testataan Luken mikrobikokoelmassa säilytettyjen tärkeimpien varastotauteja aiheuttavien sienten patogeenisuutta yksittäisinä ja sekainfektioina porkkanassa.

WP2: Eri sienten mykotoksiinituotantopotentiaalia tutkitaan riisiviljelmillä Haapalainen ym. (2022) (DOI: 10.1111/aab.12737) kuvaamalla tavalla. Porkkanoiden toteutunutta mykotoksiinituotantoa analysoidaan oireellisista porkkanakudoksista [WP1]. Ensin kehitetään ja validoidaan näytteenkäsittelymenetelmä, jonka avulla mykotoksiinit voidaan uuttaa ja määrittää suoraan porkkananäytteistä UHPLC-MS/MS-laitteistolla.