Rapid Detect – Transboundary Action: Fast Species Detection using LAMP
LAMPIAS
Hankkeen tavoite
Hankkeen päätavoitteena on parantaa luonnon monimuotoisuuden suojelua sekä vieraslajien ja tautien hallintaa Pohjois-Fennoskandiassa kehittämällä LAMP-menetelmään (Loop-mediated Isothermal Amplification) perustuvia työkaluja lajien tunnistamiseen.
LAMP on nopea ja edullinen DNA-pohjainen menetelmä, jolla lajeja voidaan tunnistaa kudos-, maa- tai vesinäytteistä (eDNA). Menetelmä sisältää kolme vaihetta:
1) DNA:n eristäminen esim. maa- tai vesinäytteestä
2) Kohde-DNA:n monistaminen vakiolämpötilassa (60–65 °C)
3) Tuloksen havaitseminen eli sen toteaminen, esiintyykö kohdelajia näytteessä
Menetelmä tuottaa tuloksen jo 15–30 minuutissa, ja kohdelajin esiintyminen voidaan todeta paljain silmin värireaktion avulla. Kun menetelmä on optimoitu, sitä voidaan käyttää ilman erityistä asiantuntemusta tai kallista laboratoriolaitteistoa.
Toimenpiteet
Hankkeessa tunnistetaan ensin yhdessä sidosryhmien kanssa keskeiset kohdelajit, joiden tunnistamiseen tarvitaan uusia työkaluja. Tämän jälkeen kehitetään ja validoidaan kohdelajeille soveltuvat LAMP-alukkeet sekä laaditaan käyttäjäystävälliset ohjeet ja laboratorioprotokollat menetelmän käyttöön.
Lisäksi hankkeessa järjestetään koulutuksia ja työpajoja, joiden avulla vahvistetaan osaamista, tiedonvaihtoa ja menetelmän käytännön soveltamista eri toimijaryhmissä.
Vaikutukset
Hanke edistää tutkijoiden ja viranomaisten välistä yhteistyötä Pohjois-Fennoskandiassa sekä lisää tietoisuutta LAMP-menetelmän mahdollisuuksista. Menetelmä tarjoaa käytännöllisen työkalun vieraslajien ja tautien varhaiseen havaitsemiseen ja seurantaan. Hankkeen kohderyhmiä ovat julkishallinto, yritykset sekä kansalaisyhteiskunnan toimijat.
