Ohrasadot uudelle tasolle genomivalinnalla

OhraGevalinta

Alkamispäivä

01.01.2014

Päättymispäivä

31.12.2021

Tavoitteet

Hankkessa kartoitamme Borealin monitahoisen ohran jalostusmateriaalin keskinäiset genomiset sukulaisuudet ja käytetyn SNP-genotyypitysalustan käyttökelpoisuuden jalostusmateriaalin geneettisen vaihtelun kuvaajana. Testaamme eri periytymismalleihin perustuvien genomisten mallien soveltuvuuden ja erityyppisten laskenta-algoritmien käyttökelpoisuuden ohran genomisessa jalostusarvostelussa. Tulosten perusteella valitaan ohran genomivalintaan sopiva jalostusarvostelumalli. MTTn geneettisen tutkimuksen tutkimuspanostus kohdistuu pääasiassa genomisen informaation sisältävän jalostusarvostelumallin kehittämiseen ja sen käytännön toteutukseen.

Tuotokset

Genotyyppitietojen, ja ristetytysten tulosten perusteella päädyttiin satoa tarkastelemaan kolmena eri ominaisuutena (GE by E yhdysvaikutukset). Lisäksi genomisessa mallissa on käytetty 1000 jyvän painoa ja valkuaispitoisuutta. Mallin tehoa on tarkasteltu cross-validaatio tekniikalla.
Ohran genominen jalostusarvosteluja käytetään risteytysten suunnittelussa.